Ερευνητές στο Πανεπιστήμιο του Galway παρουσίασαν πρόσφατα μια συλλογή 247.092 μοντέλων υπολογιστών βακτηρίων, σηματοδοτώντας τη μεγαλύτερη ψηφιακή βιβλιοθήκη βακτηρίων που έχει δημιουργηθεί ποτέ.
Το έργο αυτό που είναι γνωστό ως APOLLO παρέχει έναν νέο τρόπο μελέτης του μικροβιώματος χωρίς να βασίζεται σε αργή εργαστηριακή εργασία. Το APOLLO περιλαμβάνει λεπτομερή μοντέλα υπολογιστών που καταγράφουν τις μεταβολικές λειτουργίες κάθε βακτηρίου. Οι λειτουργίες αυτές περιλαμβάνουν τους τρόπους με τους οποίους τα μικρόβια μετατρέπουν τα θρεπτικά συστατικά σε ενέργεια και υποπροϊόντα που μπορούν να επηρεάσουν το σώμα μας. Η βιβλιοθήκη διαθέτει επίσης 14.451 προσομοιώσεις κοινότητας που βασίζονται σε πραγματικά δείγματα από διάφορες ηλικιακές ομάδες και ηπείρους.
Το μικροβίωμα είναι μια ζωντανή συλλογή βακτηρίων, ιών και άλλων μικροοργανισμών. Ένα από τα κύρια σημεία αυτής της νέας βιβλιοθήκης είναι η δυνατότητά της να αποκαλύψει συγκεκριμένες νευροτοξίνες ή ευεργετικά μόρια. Με την προσομοίωση της βακτηριακής δραστηριότητας στο έντερο, οι ερευνητές μπορούν να κατανοήσουν καλύτερα τα μεταβολικά σήματα που μπορεί να επηρεάσουν την ψυχική υγεία και τις παθήσεις που σχετίζονται με τον εγκέφαλο. Η προσέγγιση αυτή που βασίζεται σε λογισμικό επιταχύνει την έρευνα.
Το APOLLO μπορεί επίσης να προσομοιώσει πώς συμπεριφέρονται τα βακτήρια σε υποσιτισμένα παιδιά. Αυτό θα μπορούσε να είναι ιδιαίτερα σημαντικό για τις παγκόσμιες προσπάθειες υγείας για την αντιμετώπιση των επιπτώσεων του παιδικού υποσιτισμού. Τα δεδομένα του APOLLO καλύπτουν πολλαπλές τοποθεσίες σώματος, αντανακλώντας την ευρεία γεωγραφική και δημογραφική ποικιλομορφία των σύγχρονων πληθυσμών. Η μελέτη αυτών των παραλλαγών θα μπορούσε να ενημερώσει τα μέτρα δημόσιας υγείας σχετικά με τη χρήση αντιβιοτικών και τις διατροφικές οδηγίες.
Έρχονται δασμοί για τις ιντερνετικές αγορές κάτω των 150 ευρώ στην Ευρώπη;
Με τη συγχώνευση δεδομένων ασθενών με προσομοιώσεις μικροβιώματος, οι γιατροί μπορεί σύντομα να προτείνουν πιο στοχευμένες θεραπείες. Οι δοκιμές σε ανθρώπους θα εξακολουθήσουν να είναι απαραίτητες, αλλά η υπολογιστική εργασία βοηθά να τελειοποιηθούν οι πιο υποσχόμενες ιδέες. Το APOLLO αποτελεί ένα τρόπο για να γίνουν αυτές οι προσομοιώσεις πιο ολοκληρωμένες και προσβάσιμες. Η έρευνα μπορεί τελικά να οδηγήσει σε ανακαλύψεις στη διάγνωση, την ανάπτυξη φαρμάκων και την επιστήμη της διατροφής.
Η μελέτη δημοσιεύεται στο Cell Systems.
Ακολουθήστε το Techmaniacs.gr στο Google News για να διαβάζετε πρώτοι όλα τα τεχνολογικά νέα. Ένας ακόμα τρόπος να μαθαίνετε τα πάντα πρώτοι είναι να προσθέσετε το Techmaniacs.gr στον RSS feeder σας χρησιμοποιώντας τον σύνδεσμο: https://techmaniacs.gr/feed/.
